Το οχυρωμένο μοναστήρι του Αγκαράθου βρίσκεται 23 χιλιόμετρα ανατολικά του Ηρακλείου σε μια κατάφυτη τοποθεσία, σε υψόμετρο 538 μέτρων κοντά στην Επισκοπή. Το μοναστήρι, ειδικά κατά την Ενετοκρατία, ήταν μία από τις πλουσιότερες περιοχές στην Κρήτη και είχε στην κατοχή του πολλές άλλες μονές που ανήκουν στους νομούς του Ηράκλειου και του Λασιθίου. Θεωρείται ο πρώτος στην ιεραρχία των μοναστηριών του νησιού.
Το όνομα της μονής προέρχεται από το φυτό φασκόμηλο της Ιερουσαλήμ (Ασφάκα), που ονομάζεται αγκαραθιά στην κρητική διάλεκτο. Σύμφωνα με την παράδοση, κάτω από ένα τέτοιο φυτό ένας μοναχός βρήκε την εικόνα της Παναγίας και αργότερα χτίστηκε η εκκλησία της Παναγίας στον ίδιο χώρο. Μπροστά από την εκκλησία θα δείτε μια ροδιά με ένα κερί κοντά τον κορμό του. Το ρόδι λέγεται ότι είναι το αρχικό φυτό της αγκαραθιάς, η οποία μετατράπηκε ως εκ θαύματος σε ένα δέντρο.